斯坦福大学学制与其他大学不同。在校规中,把一年分成四个季度,即春、夏、秋、冬四个学期,学生们每段都要选不同的课。因此,斯坦福大学的学生比那些两学期制大学的学生学习的课程要多,压力也比其他大学的学生要大。该校学生必须在九个领域完成必修课,其中包括文化与思想、自然科学、科技与实用科学、文学和艺术、哲学、社会科学和宗教思想。除此之外,学生的写作和外语也必须达到一定标准。斯坦福大学最近把非西方社会作家的作品加入到它全年的西方文化核心教纲中时,引起了学术界的注意。
斯坦福大学生物科学系开设MS项目和PHD项目,分别为1年和5-6年。MS项目:申请者不需有生物学本科学位,但是应学过数学、化学、物理学和本科高年级的生物学或相关课程。GPA 至少3.0,但是如果总体实力很强,也会放宽对GPA和GRE的要求。
PHD项目:申请者应具有斯坦福大学生物系本科学位的同等学历。TOEFL最低应达到92,所有学生均需选择参加下述一门GRE单项考试:生物学、化学、生物化学、细胞和分子生物学。